此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SAGx.
Bioconductor版本:3.11
用于从Affymetrix基因芯片中检索、准备和分析数据的软件包。特别是鉴别差异表达基因的问题。
作者:Per Broberg
维护者:Per Broberg,
引文(从R内,输入引用(“SAGx”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SAGx")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SAGx”)
R脚本 | Samroc -示例 | |
参考手册 |
biocViews | 聚类,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,KEGG,微阵列,MultipleComparison,OneChannel,通路,预处理,回归,软件 |
版本 | 1.62.0 |
在Bioconductor | BioC 1.9 (R-2.4)(14年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.5.0), stats,乘、方法 |
进口 | Biobase, stats4 |
链接 | |
建议 | KEGG.db,hu6800.db,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://home.swipnet.se/pibroberg/expression_hemsida1.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SAGx_1.62.0.tar.gz |
Windows二进制 | SAGx_1.62.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | SAGx_1.62.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SAGx |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SAGx |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SAGx/ |
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