SAGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.SAGx

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SAGx

基因芯片的统计分析

Bioconductor版本:3.11

用于从Affymetrix基因芯片中检索、准备和分析数据的软件包。特别是鉴别差异表达基因的问题。

作者:Per Broberg

维护者:Per Broberg,

引文(从R内,输入引用(“SAGx”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SAGx")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SAGx”)

PDF R脚本 Samroc -示例
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类DataImportDifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichmentKEGG微阵列MultipleComparisonOneChannel通路预处理回归软件
版本 1.62.0
在Bioconductor BioC 1.9 (R-2.4)(14年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.5.0), stats,、方法
进口 Biobase, stats4
链接
建议 KEGG.dbhu6800.db质量
SystemRequirements
增强了
URL http://home.swipnet.se/pibroberg/expression_hemsida1.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SAGx_1.62.0.tar.gz
Windows二进制 SAGx_1.62.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) SAGx_1.62.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SAGx
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SAGx
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SAGx/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网