Rqc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rqc

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rqc

高通量测序数据的质量控制工具

Bioconductor版本:3.11

Rqc是一个优化工具用于高通量测序数据的质量控制和评估。它执行并行处理整个文件并生成一个报告,包含一组高分辨率图形。

作者:Welliton Souza, Benilton卡瓦略< beniltoncarvalho gmail.com >

维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“Rqc”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Rqc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Rqc”)

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文本 新闻

细节

biocViews DataImport,质量控制,测序,软件
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 BiocParallel,ShortRead,ggplot2
进口 BiocGenerics(> = 0.25.1),Biostrings,IRanges、方法、S4Vectors,knitr(> = 1.7),BiocStyle,plyr,减价、网格reshape2,Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase,闪亮的,Rsamtools,GenomicAlignments,GenomicFiles
链接 Rcpp
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/labbcb/Rqc
BugReports https://github.com/labbcb/Rqc/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Rqc_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉) Rqc_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rqc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网