RiboProfiling

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RiboProfiling。

核糖体分析数据分析:从BAM数据表示和解释

Bioconductor版本:3.11

BAM文件开始,这个包的质量评估提供了必要的功能,阅读起始位置校准,读取cd上的计算,3 'utr和5 'utr,策划的统计数据:对,日志叠化,密码子频率和覆盖评估,主成分分析在密码子的报道。

作者:亚历山德拉Popa

维护人员:a . Popa < alexandra.mariela。在gmail.com popa >

从内部引用(R,回车引用(“RiboProfiling”)):

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RiboProfiling”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RiboProfiling”)

PDF	R脚本	分析Ribo-Seq数据与“RiboProfiling”包
PDF		参考手册
文本		新闻

biocViews	对齐,报道,PrincipalComponent,质量控制,RiboSeq,测序,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.2.2)