Rcwl

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rcwl

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rcwl。

包装使用CWL命令工具和管道

Bioconductor版本:3.11

包可以是一个简单和友好的方式来管理命令行工具,建立数据分析管道在使用通用工作流语言R (CWL)。

作者:羌胡(aut (cre),钱氏(aut)

维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Rcwl”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Rcwl”)

HTML	R脚本	用户指南Rcwl
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ImmunoOncology,软件,WorkflowStep
版本	1.4.8
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年)
许可证	GPL-2 |文件许可证
取决于	R (> = 3.6),yaml、方法、S4Vectors
进口	跑龙套,统计数据,BiocParallel,batchtools,图,闪亮的,R.utils,codetools
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements	python (> = 2.7), cwltool (> = 1.0.2018)
增强了
URL
取决于我	RcwlPipelines
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Rcwl_1.4.8.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	Rcwl_1.4.8.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rcwl
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rcwl
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rcwl/
包下载报告	下载数据