RNAprobR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAprobR

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAprobR。

R包基于大规模并行测序分析RNA结构探测数据

Bioconductor版本:3.11

这个包可以促进新一代测序数据的分析与单核苷酸位置信息的决议是一个关键。它允许应用不同类型的相关标准化,数据可视化和出口表中或UCSC bedgraph文件兼容。

作者:卢卡斯-凯乌平斯基1月(aut) Nikos Sidiropoulos (cre, aut) Jeppe Vinther (aut)

维修工:Nikos Sidiropoulos < Nikos。在gmail.com sidiro >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAprobR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RNAprobR”)

PDF	R脚本	RNAprobR: R包基于大规模并行测序分析RNA结构探测的方法
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,GenomeAnnotation,归一化,测序,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),BiocGenerics(> = 0.10.0)
进口	Biostrings(> = 2.32.1),GenomicRanges(> = 1.16.4),IRanges(> = 2.10.5),Rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),GenomicAlignments(> = 1.5.12),S4Vectors(> = 0.14.7)、图形、统计,跑龙套
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAprobR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	RNAprobR_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RNAprobR_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAprobR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAprobR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAprobR/
包下载报告	下载数据