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RNAmodR。RiboMethSeq
DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.RiboMethSeq
此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAmodR。RiboMethSeq．
RiboMethSeq检测2'-O甲基化
Bioconductor版本:3.11
RNAmodR。RiboMethSeq implements the detection of 2'-O methylations on RNA from experimental data generated with the RiboMethSeq protocol. The package builds on the core functionality of the RNAmodR package to detect specific patterns of the modifications in high throughput sequencing data.
作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]
，丹尼斯·拉方丹[ctb, fft]
维护人员:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上说
引用(从R中，输入引用(“RNAmodR.RiboMethSeq”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“RNAmodR.RiboMethSeq”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RNAmodR。RiboMethSeq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 测序，软件，可视化，WorkflowStep |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.10 (R-3.6)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，RNAmodR |
| 进口 | 方法,S4Vectors，BiocGenerics，IRanges，GenomicRanges，Gviz |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，rtracklayer，RNAmodR。数据 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq |
| BugReports | https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | RNAmodR.RiboMethSeq_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RNAmodR.RiboMethSeq_1.2.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | RNAmodR.RiboMethSeq_1.2.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.RiboMethSeq |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.RiboMethSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.RiboMethSeq/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
