此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAmodR。AlkAnilineSeq.
Bioconductor版本:3.11
RNAmodR。AlkAnilineSeq从AlkAnilineSeq协议生成的实验数据中检测RNA上的m7G, m3C和D修饰。该包构建在RNAmodR包的核心功能之上,用于检测高通量测序数据中修改的特定模式。
作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre],丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]
维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道
引文(从R内,输入引用(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR.AlkAnilineSeq")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)
超文本标记语言 | R脚本 | RNAmodR。AlkAnilineSeq |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 测序,软件,可视化,WorkflowStep |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | bio3.10 (R-3.6)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.6),RNAmodR |
进口 | 方法,S4Vectors,IRanges,BiocGenerics,GenomicRanges,Gviz |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,rtracklayer,Biostrings,RNAmodR。数据 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq |
BugReports | https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RNAmodR。毫升 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq/ |
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