这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAinteract。
Bioconductor版本:3.11
RNAinteract估计基因相互作用等多维家里从图像中提取特征。屏幕被认为是进行多井盘子或类似的设计。从一个列表的功能(如细胞数量、面积、荧光强度)每好,估计遗传交互。包提供了交互功能报告基因对,策划的热图和双RNAi情节。可以编写一个HTML报告质量控制和分析。
作者:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >
维护人员:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“RNAinteract”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAinteract”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RNAinteract”)
R脚本 | RNAinteract | |
参考手册 |
biocViews | CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,质量控制,软件,可视化 |
版本 | 1.36.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.12.0),abind,locfit,Biobase |
进口 | RColorBrewer,ICS,ICSNP,cellHTS2,geneplotter,gplots、网格hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、splots(> = 1.13.12) |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | RNAinteractMAPK |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | RNAinteract_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | RNAinteract_1.36.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | RNAinteract_1.36.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAinteract |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/ |
包下载报告 | 下载数据 |