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RNAAgeCalc
DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAAgeCalc
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAAgeCalc。
multi-tissue转录年龄计算器
Bioconductor版本:3.11
它已经表明,DNA甲基化和RNA转录都与实足年龄和年龄相关的疾病。开发了几个估计预测人类衰老从DNA水平和RNA水平。大部分的人类转录年龄预测是基于微阵列数据和有限的只有少数组织。迄今为止,转录老龄研究使用RNASeq来自不同人体组织的数据是有限的。本方案的目的是提供一个工具across-tissue和组织转录年龄计算基于GTEx RNASeq数据。
作者:徐任(aut (cre),裴分矿(aut)
维护人员:徐任< xuren2120 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“RNAAgeCalc”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAAgeCalc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RNAAgeCalc”)
| HTML | R脚本 | RNAAgeCalc |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,RNASeq,软件 |
| 版本 | 1.0.2中 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | ggplot2,重新计票,嫁祸于,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db统计数据,SummarizedExperiment、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc |
| BugReports | https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RNAAgeCalc_1.0.2.tar.gz |
| Windows二进制 | RNAAgeCalc_1.0.2.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | RNAAgeCalc_1.0.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAAgeCalc |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAAgeCalc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAAgeCalc/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
