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RMassBank
DOI:10.18129 / B9.bioc.RMassBank
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RMassBank。
工作流过程串联文件女士和构建MassBank记录
Bioconductor版本:3.11
工作流过程串联文件女士和构建MassBank记录。功能包括自动提取光谱女士串联,公式分配串联女士片段,调整与指定片段串联女士光谱,光谱清理,自动从互联网数据库,检索化合物信息和出口MassBank记录。
作者:迈克尔•Stravs艾玛·Schymanski Steffen Neumann埃里克•穆勒Schulze托拜厄斯的贡献
维护人员:RMassBank Eawag < massbank在eawag.ch >
从内部引用(R,回车引用(“RMassBank”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RMassBank”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RMassBank”)
| R脚本 | RMassBank非标准用法 | |
| R脚本 | RMassBank使用XCMS预排 | |
| R脚本 | RMassBank预排 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学,ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
| 版本 | 2.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(8年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Rcpp |
| 进口 | XML,RCurl,rjson,S4Vectors,消化,rcdk,yaml,mzR、方法、Biobase,MSnbase,httr,enviPat |
| 链接 | |
| 建议 | gplots,RMassBankData,xcms(> = 1.37.1),相机,RUnit |
| SystemRequirements | OpenBabel |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | RMassBankData |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RMassBank_2.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RMassBank_2.16.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | RMassBank_2.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RMassBank |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RMassBank |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RMassBank/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
