RJMCMCNucleosomes

DOI:10.18129 / B9.bioc.RJMCMCNucleosomes

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RJMCMCNucleosomes

贝叶斯层次模型与高通量基因组核小体定位短内容数据(MNase-Seq)

Bioconductor版本:3.11

这个包是核小体定位使用信息Multinomial-Dirichlet之前与可逆跳转t-mixture估计全基因组分析的核小体的位置。

作者:帕斯卡Belleau (aut) Rawane Samb (aut),阿斯特丽德Deschenes (cre, aut),埃塞俄比亚Khadraoui (aut) Lajmi Lakhal-Chaieb (aut) Arnaud所有权(aut)

维护人员:阿斯特丽德Deschenes < adeschen hotmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“RJMCMCNucleosomes”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RJMCMCNucleosomes”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RJMCMCNucleosomes”)

HTML R脚本 核小体定位
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 贝叶斯,BiologicalQuestion,ChIPSeq,报道,NucleosomePositioning,测序,软件,StatisticalMethod
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.4),IRanges,GenomicRanges
进口 Rcpp(> = 0.12.5),consensusSeekeR,BiocGenerics,GenomeInfoDb,S4Vectors(> = 0.23.10),BiocParallel、统计数据、图形、方法grDevices
链接 Rcpp
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,nucleoSim,RUnit
SystemRequirements Rcpp
增强了
URL https://github.com/ArnaudDroitLab/RJMCMCNucleosomes
BugReports https://github.com/ArnaudDroitLab/RJMCMCNucleosomes/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 RJMCMCNucleosomes_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 RJMCMCNucleosomes_1.12.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) RJMCMCNucleosomes_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RJMCMCNucleosomes
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RJMCMCNucleosomes
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RJMCMCNucleosomes/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网