redseq
doi：10.18129/b9.bioc.redseq
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅redseq。
通过限制酶消化处理的高通量测序数据分析
生物导体版本：3.11
该软件包包括构建限制酶切割位点（REC）地图的功能，使用五种不同的方法在地图上分布映射的序列，为样品找到富集/耗尽的REC，并识别样品之间的差异丰富/耗尽的REC。
作者：Lihua Julie Zhu和Thomas Fazzio
维护者：Lihua Julie Zhu
引用（从r内，输入引用（“ redseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ redseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ redseq”）
| R脚本 | Redseq小插图 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 预处理，，，，测序，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.34.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（9年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.5.0），生物基因，，，，bsgenome.celegans.ucsc.ce2，，，，多检验，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，Chippeakanno |
| 进口 | AnnotationDbi，图形，iranges（> = 1.13.5），统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | redseq_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | redseq_1.34.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | redseq_1.34.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/redseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/redseq |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/redseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
