R3CPET

DOI:10.18129 / B9.bioc.R3CPET

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见R3CPET．

3CPET:利用分层狄利克雷过程在Chia-PET实验中寻找协因子配合物

Bioconductor版本:3.11

该包提供了一种方法来推断一组蛋白质，这些蛋白质更有可能一起工作以维持染色质相互作用，给出了一个ChIA-PET实验结果。

作者:Djekidel MN，杨晨等。

维护者:Mohamed Nadhir Djekidel

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("R3CPET")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“R3CPET”)

PDF	R脚本	3CPET:寻找维持Chia-PET相互作用的辅因子复合物
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，GeneExpression，GenePrediction，GraphAndNetwork，嗝，网络，NetworkInference，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.2)，Rcpp(>= 0.10.4)，方法
进口	方法，平行，线索，ggplot2，pheatmap，clValid，igraph，data.table，reshape2，Hmisc，RCurl，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.31.8),ggbio
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，biovizBase，biomaRt，AnnotationDbi，org.Hs.eg.db，闪亮的，ChIPpeakAnno
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sirusb/R3CPET/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	R3CPET_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	R3CPET_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	R3CPET_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/R3CPET
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/R3CPET/
软件包下载报告	下载数据