王子

DOI:10.18129 / B9.bioc.PrInCE

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见王子．

从共洗脱预测相互作用体

Bioconductor版本:3.11

PrInCE(从共洗脱中预测相互作用组)使用在数据集衍生特征上训练的朴素贝叶斯分类器，从共洗脱色谱图谱中恢复蛋白质-蛋白质相互作用。这个包包含PrInCE的R实现。

作者:Michael skinner [aut, trl, cre]， R. Greg Stacey [ctb]， Nichollas Scott [ctb]， Anders Kristensen [ctb]， Leonard Foster [aut, leading]

维护者:Michael Skinnider < Michael。在msl.ubc.ca>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PrInCE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“王子”)

超文本标记语言	R脚本	PrInCE共洗脱数据的相互作用组重建
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	NetworkInference，蛋白质组学，软件，SystemsBiology
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(1.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	purrr(> = 0.2.4),dplyr(> = 0.7.4),tidyr(> = 0.8.99),预测(> = 8.2),进步(> = 1.1.2),Hmisc(> = 4.0),naivebayes(> = 0.9.1),robustbase(> = 0.92 7),管理员(> = 0.8.0),LiblineaR(> = 2.10 8),speedglm(> = 0.3 2),测试人员(> = 0.1.7),magrittr(> = 1.5),Biobase(> = 2.40.0),MSnbase(>= 2.8.3)，统计，utils，方法，Rdpack(> = 0.7)
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/fosterlab/PrInCE/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	PrInCE_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	PrInCE_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	PrInCE_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PrInCE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PrInCE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PrInCE/
软件包下载报告	下载数据