PowerExplorer

DOI:10.18129 / B9.bioc.PowerExplorer

此包适用于Bioconductor 3.11版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见PowerExplorer．

用于RNA-Seq和蛋白质组学数据的功率估计工具

Bioconductor版本:3.11

使用模拟数据估计和预测组间和多个样本量之间的功率，模拟是基于从提供的输入数据集中估计的分布参数进行操作的。

作者:徐乔[aut, cre]，劳拉·埃洛[cph]

维护者:徐乔<徐。乔在utu.fi>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PowerExplorer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“PowerExplorer”)

PDF	R脚本	PowerExplorer手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，报道，DifferentialExpression，ImmunoOncology，MultipleComparison，蛋白质组学，RNASeq，测序，软件
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)，SummarizedExperiment
进口	DESeq2，腐烂，vsn，统计，utils，方法，gridExtra，质量，data.table，ggplot2，Biobase，S4Vectors，BiocParallel
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://gitlab.utu.fi/CompBioMedNGSTools/PowerExplorer
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	PowerExplorer_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	PowerExplorer_1.7.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PowerExplorer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PowerExplorer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PowerExplorer/
软件包下载报告	下载数据