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NBAMSeq
DOI:10.18129 / B9.bioc.NBAMSeq
此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见NBAMSeq．
RNA-Seq数据的负二项式加性模型
Bioconductor版本:3.11
高通量测序实验和差异表达分析是一种广泛应用的检测基因组生物标志物的方法。差异表达分析的一个基本步骤是建立基因计数和相关协变量之间的关联模型。NBAMSeq是一种基于广义可加性模型的灵活统计模型，允许在方差估计中跨基因共享信息。
作者:徐仁[aut, cre]，裴芬宽[aut]
维护人员:徐仁
引文(从R内，输入引用(“NBAMSeq”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("NBAMSeq")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NBAMSeq”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RNA-Seq数据的负二项式加性模型 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 报道，DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，SummarizedExperiment，S4Vectors |
| 进口 | DESeq2，mgcv-24年(> = 1.8),BiocParallel，genefilter、方法、统计 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat，ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/reese3928/NBAMSeq |
| BugReports | https://github.com/reese3928/NBAMSeq/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NBAMSeq_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | NBAMSeq_1.4.1.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NBAMSeq_1.4.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBAMSeq |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NBAMSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NBAMSeq/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
