主题
doi：10.18129/b9.bioc.motifdb
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅主题。
蛋白-DNA结合序列基序的注释集合
生物导体版本：3.11
来自14个公共源的9900多个注释位置频率矩阵，用于多种生物。
作者：保罗·香农（Paul Shannon），马特·理查兹（Matt Richards）
维护者：Paul Shannon
引用（从r内，输入引用（“ MotifDB”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ motifdb”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ MotifDB”）
| html | R脚本 | PWMS的集合 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 图案，，，，软件 |
| 版本 | 1.30.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（8年） |
| 执照 | Artistic-2.0 |文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，生物弦 |
| 进口 | rtracklayer，，，，SplitStackShape |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，seqlogo，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 结肠管制，，，，Motifbreakr，，，，特雷娜 |
| 进口我 | IGVR，，，，rtrmui |
| 建议我 | atacseqqc，，，，difflogo，，，，mmdiff2，，，，主题，，，，Motifstack，，，，概括者访问者，，，，pwmenrich，，，，rtrm，，，，tfutils，，，，Universalmotif，，，，vtpnet |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | motifdb_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | motifdb_1.30.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | motifdb_1.30.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifdb |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/motifdb |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/motifdb/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
