遐
DOI:10.18129 / B9.bioc.MOFA
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅遐。
Multi-Omics因子分析(外交部)
Bioconductor版本:3.11
Multi-Omics因素分析:一个无监督框架的集成Multi-Omics数据集。
作者:Ricard Argelaguet,布丽塔一起创造Velten, Damien Arnol,御马布特尼,沃尔夫冈•休伯奥利弗Stegle
维护人员:布丽塔一起创造Velten <布丽塔一起创造。在gmail.com velten >
从内部引用(R,回车引用(“遐”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“遐”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“遐”)
| HTML | R脚本 | 介绍遐 |
| HTML | R脚本 | 遐:应用单细胞multi-omics数据集 |
| HTML | R脚本 | 外交部:应用multi-omics慢性淋巴细胞白血病患者的数据集 |
| HTML | R脚本 | 外交部:如何评估模型的鲁棒性和模型选择 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,DimensionReduction,软件,可视化 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年) |
| 许可证 | LGPL-3 |文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | rhdf5,dplyr,reshape2,pheatmap,corrplot,ggplot2,ggbeeswarm、方法、尺度,GGally,RColorBrewer,cowplot,ggrepel,MultiAssayExperiment,Biobase,doParallel,foreach,网状,统计grDevices跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,MOFAdata |
| SystemRequirements | Python (> = 2.7.0)、numpy大熊猫,h5py, scipy, sklearn mofapy |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MOFA_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MOFA_1.4.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | MOFA_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MOFA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/遐差 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MOFA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
