MMUPHin

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMUPHin

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MMUPHin。

荟萃分析方法统一的异质性在微生物研究管道

Bioconductor版本:3.11

MMUPHin R包微生物群的荟萃分析的任务。它有功能接口:一批)covariate-controlled效应调整,b)荟萃分析微分丰富测试,c)无监督离散元分析结构(集群)的发现,和d)分析无监督连续结构的发现。

作者:马本

维护人员:马本< siyuanma g.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MMUPHin”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“MMUPHin”)

HTML	R脚本	MMUPHin
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect,宏基因组,微生物组,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6)
进口	Maaslin2,metafor,fpc,igraph,ggplot2,dplyr,tidyr,cowplotgrDevices跑龙套,统计数据
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,magrittr,素食主义者,phyloseq,curatedMetagenomicData,genefilter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MMUPHin_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MMUPHin_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MMUPHin_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMUPHin
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MMUPHin
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MMUPHin/
包下载报告	下载数据