这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mbt。
Bioconductor版本:3.11
mbt方法由βt Baggerly et al(2003)的方法。相比baySeq(硬城堡和凯利2010年),DESeq(2010年安德斯和Huber)和准确的测试(罗宾逊2007年史密斯,2008)和麦卡锡et al(2012)的漠视,mbt高工作效率,也就是说,它具有高功率,高罗斯福的保守估计和高稳定性。mbt是西装——能够转录组数据,标记数据,SAGE数据(统计数据)小样本或几个复制库。它可以用来识别基因,信使rna亚型或标签两种情况之间的差异表达。
作者:Yuan-De谭
维护人员:Yuan-De Tan < tanyuande gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(mbt)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(mbt)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (mbt)
R脚本 | 分析与“mbt”包RNA-Seq计数数据 | |
MBttest-manual.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,MultipleComparison,圣人,测序,软件,转录 |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(> = 3.3.0),统计数据,gplots,gtools、图形、基地,跑龙套,grDevices |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MBttest_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBttest_1.16.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | MBttest_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mbt |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MBttest/ |
包下载报告 | 下载数据 |