MADSEQ

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MADSEQ。

马赛克异倍性检测和量化使用大规模并行测序数据

Bioconductor版本:3.11

MADSEQ包提供了一组分层Bayeisan模型检测的马赛克非整倍性,推理类型的非整倍体和非整倍体的量化分数的细胞样本。

作者:于香港,亚当Auton约翰·默里Greally

维护人员:于香港<玉。香港在phd.einstein.yu.edu >

从内部引用(R,回车引用(“MADSEQ”)):

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MADSEQ”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MADSEQ”)

biocViews	贝叶斯,CopyNumberVariation,报道,GenomicVariation,测序,软件,SomaticMutation,VariantDetection
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4),rjags(> = 4 - 6)
进口	VGAM,coda,