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KEGGprofile
DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGprofile
此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见KEGGprofile．
KEGG通路中多类型多组表达数据的注释和可视化包
Bioconductor版本:3.11
KEGGprofile是一个集成了KEGG路径图中的表达式配置文件和功能注释的注释和可视化工具。多类型、多组的表达数据可以在一个路径图中可视化。KEGGprofile有助于更详细地分析不同基因和样本的特定功能变化内在通路或时间相关性。
作者:赵世林，郭燕，于夏
维护者:赵世林<世林。赵在vanderbilt.edu>
引文(从R内，输入引用(“KEGGprofile”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("KEGGprofile")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“KEGGprofile”)
| R脚本 | KEGGprofile:应用示例 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | KEGG，通路，软件 |
| 版本 | 1.30.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(8年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | AnnotationDbi，png，TeachingDemos，XML，KEGG.db，KEGGREST，biomaRt，RCurl，ggplot2，reshape2 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | IntramiRExploreR |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | KEGGprofile_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | KEGGprofile_1.30.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | KEGGprofile_1.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGprofile |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KEGGprofile |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGprofile/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
