哈曼
doi：10.18129/b9.bioc.harman
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅哈曼。
使用PCA和基于优化的技术从数据集中删除批处理效应
生物导体版本：3.11
Harman是一种基于PCA和受约束优化的技术，可最大程度地利用数据集中的批处理效应，并限制过度校正的概率（即去除真正的生物学信号以及批处理噪声）保持在最终 - 设定的部分。用户。
作者：Josh Bowden [Aut]，Jason Ross [AUT，CRE]，Yalchin Oytam [aut]
维护者：Jason Ross
引用（从r内，输入引用（“ Harman”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ harman”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Harman”）
| html | R脚本 | 简介Toharman |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，DNAMETHYLATY，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，正常化，，，，预处理，，，，委托人，，，，软件，，，，统计信息，，，，转录 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（4。5年） |
| 执照 | GPL-3 +文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | RCPP（> = 0.11.2），图形，统计，方法 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | Harmandata，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，运行，，，，rcolorbrewer，，，，BladderBatch，，，，林玛，，，，Minfi，，，，Lumi，，，，MSMSEDA，，，，Affydata，，，，Minfidata，，，，SVA |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/ |
| BugReports | https://github.com/jasonr055/harman/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 碎片器 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Harman_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Harman_1.16.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Harman_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/harman |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/Harman |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/harman/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
