HTSFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTSFilter

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见HTSFilter．

筛选复制的高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:3.11

该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序，以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。

作者:Andrea Rau, Melina Gallopin, Gilles Celeux, Florence Jaffrezic

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HTSFilter")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HTSFilter”)

PDF	R脚本	HTSFilter装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，RNASeq，测序，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.10.1),DESeq(> = 1.22.1),BiocParallel(> = 3),Biobase， utils，统计，grDevices，图形，方法
链接
建议	EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	coseq
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HTSFilter_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	HTSFilter_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	HTSFilter_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTSFilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
软件包下载报告	下载数据