GmicR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GmicR

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GmicR．

结合WGCNA和xCell读数与贝叶斯网络学习，生成基因模块免疫细胞网络(GMIC)

Bioconductor版本:3.11

该软件包使用贝叶斯网络学习来检测由WGCNA检测到的基因模块和由xCell定义的免疫细胞签名之间的关系。它是一个假设生成工具。

作者:Richard Virgen-Slane

维护者:Richard Virgen-Slane

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GmicR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GmicR”)

超文本标记语言	R脚本	GmicR_vignette
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，GUI，GeneExpression，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，网络，NetworkInference，质量控制，软件，SystemsBiology
版本	1.2.0
在Bioconductor	bio3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL-2 +文件许可证
取决于
进口	AnnotationDbi，猿，bnlearn，类别，DT，doParallel，foreach，gRbase，GSEABase，粮食，GOstats，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，闪亮的，WGCNA，data.table， grDevices，图形，reshape2，统计，效用
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GmicR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	GmicR_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GmicR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GmicR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GmicR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GmicR/
软件包下载报告	下载数据