这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOstats。
Bioconductor版本:3.11
相互作用的一组工具和微阵列数据。各种基本操作工具图,假设检验和其他简单的计算。
作者:罗伯特先生(aut),赛斯猎鹰(施),罗伯特·Castelo[所有],Bioconductor包维护者(cre)
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“GOstats”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GOstats”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GOstats”)
R脚本 | 超几何测试不太常见的生物模型 | |
R脚本 | 使用GOstats超几何测试 | |
R脚本 | 使用GOstats可视化数据 | |
参考手册 |
biocViews | 注释,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,MultipleComparison,通路,软件 |
版本 | 2.54.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 15.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图 |
进口 | 方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),AnnotationForge,Rgraphviz |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,乘,genefilter,RColorBrewer,xtable,SparseM,GSEABase,geneplotter,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | MineICA,PloGO2,RDAVIDWebService |
进口我 | affycoretools,吸引,categoryCompare,GmicR,理想的,MIGSA,miRLAB,pcaExplorer,ReportingTools,scTensor,systemPipeR |
建议我 | a4,BiocCaseStudies,类别,eisa,fastLiquidAssociation,GSEAlm,interactiveDisplay,MineICA,中长期规划,MmPalateMiRNA,qpgraph,RnBeads,安全 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | GOstats_2.54.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOstats_2.54.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | GOstats_2.54.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOstats |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/ |
包下载报告 | 下载数据 |