GISPA

DOI:10.18129 / B9.bioc.GISPA

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GISPA．

GISPA:基因集成集谱分析方法

Bioconductor版本:3.11

GISPA是一种用于研究人员的方法，他们有兴趣定义具有相似的先验特定分子谱的基因集。GISPA方法此前发表在《核酸研究》(Kowalski et al.， 2016;PMID: 26826710)。

作者:Bhakti Dwivedi和Jeanne Kowalski

维护者:Bhakti Dwivedi < Bhakti。Dwivedi at emory.edu>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GISPA”)

超文本标记语言	R脚本	GISPA:基因集成集谱分析方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment，GenomeWideAssociation，软件，StatisticalMethod
版本	1.12.0
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.2)
进口	Biobase，changepoint，data.table，genefilter、图形、GSEABase，HH，晶格，latticeExtra，plyr，scatterplot3d,统计数据
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GISPA_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	GISPA_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GISPA_1.12.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GISPA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GISPA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GISPA/
软件包下载报告	下载数据