GENIE3

DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GENIE3．

树集合的基因网络推理

Bioconductor版本:3.11

这个包实现了GENIE3算法，用于从表达数据推断基因调控网络。

作者:Van Anh Huynh-Thu, Sara Aibar, Pierre Geurts

维护者:Van Anh Huynh-Thu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GENIE3")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GENIE3”)

超文本标记语言	R脚本	GENIE3
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DecisionTree，GeneExpression，GraphAndNetwork，网络，NetworkInference，回归，软件，SystemsBiology
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口	统计数据,reshape2
链接
建议	knitr，rmarkdown，foreach，doRNG，doParallel，Biobase，SummarizedExperiment，testthat、方法
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	MetNet，netbenchmark
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GENIE3_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	GENIE3_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GENIE3_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GENIE3
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GENIE3/
软件包下载报告	下载数据