FunciSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.FunciSNP

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FunciSNP。

集成功能的非编码数据集与识别候选基因关联研究监管snp

Bioconductor版本:3.11

从GWAS FunciSNP集成信息,1000和染色质特征识别功能基因组SNP编码或非编码区域。

作者:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >和Houtan Noushmehr博士< Houtan在usp.br >

维护人员:西蒙·g·Coetzee西蒙< simoncoetzee.com >

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FunciSNP”)

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PDF	R脚本	FunciSNP装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	注释,DataImport,DataRepresentation,基础设施,SequenceMatching,软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.14.0),ggplot2,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,FunciSNP.data
进口	方法,BiocGenerics,Biobase,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1),ChIPpeakAnno(> = 2.2.0),VariantAnnotation,plyr,snpStats,ggplot2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),尺度
链接
建议	org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL	http://coetzeeseq.usc.edu/publication/Coetzee_SG_et_al_2012/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

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源包	FunciSNP_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	FunciSNP_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	FunciSNP_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FunciSNP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FunciSNP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FunciSNP/
包下载报告	下载数据