FGNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.FGNet

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见FGNet．

功能基因网络来源于生物富集分析

Bioconductor版本:3.11

在多个注释空间中，从富集分析的聚类中构建并可视化功能基因和术语网络。该软件包包括一个图形用户界面(GUI)和通过DAVID、GeneTerm Linker、gage (GSEA)和topGO执行功能丰富分析的功能。

作者:Sara Aibar, Celia Fontanillo, Conrad Droste和Javier De Las Rivas。

维护者:Sara Aibar

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("FGNet")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“FGNet”)

超文本标记语言	R脚本	FGNet
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，聚类，FunctionalGenomics，去，GeneSetEnrichment，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，可视化
版本	3.22.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.15)
进口	igraph(> = 0.6),hwriter，R.utils，XML，plotrix，reshape2，RColorBrewer，png，方法，统计，utils，图形，grDevices
链接
建议	RCurl，RDAVIDWebService，计，topGO，GO.db，reactome.db，RUnit，BiocGenerics，org.Sc.sgd.db，knitr，rmarkdown，AnnotationDbi，RGtk2，BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cicancer.org
全靠我
进口我	IntramiRExploreR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	FGNet_3.22.1.tar.gz
Windows二进制	FGNet_3.22.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	FGNet_3.22.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FGNet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FGNet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FGNet/
软件包下载报告	下载数据