有限元法

DOI:10.18129 / B9.bioc.FEM

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅有限元法。

识别功能后生模块

Bioconductor版本:3.11

有限元包执行系统性综合分析DNA甲基化和基因表达数据。它寻求模块功能相关基因的展览微分启动子DNA甲基化和微分表达式,在逆启动子DNA甲基化与基因表达之间的关系。有关详细信息,请参见2014年焦等生物信息学。

作者:安德鲁·e·Teschendorff和甄杨

维护人员:杨甄< yangzhen picb.ac.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“有限元”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“有限元”)

PDF	R脚本	有限元包执行系统性综合分析DNA methylationa和基因表达。它寻求模块功能相关基因的展览微分启动子DNA甲基化和微分表达式,在逆启动子DNA甲基化与基因表达之间的关系。有关详细信息,请参见2014年焦等生物信息学。
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,DifferentialMethylation,NetworkEnrichment,软件,SystemsBiology
版本	3.15.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	AnnotationDbi,矩阵,marray,corrplot,igraph,嫁祸于,limma,org.Hs.eg.db,图,BiocGenerics
进口	图
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	FEM_3.15.0.tar.gz
Windows二进制	FEM_3.15.0.zip
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FEM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/有限元法
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FEM/
包下载报告	下载数据