ExpressionView

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionView

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ExpressionView

可视化在基因表达数据中识别的双簇

Bioconductor版本:3.11

ExpressionView可视化了基因表达矩阵中可能重叠的双簇。它可以使用ISA方法(eisa包)的结果,也可以使用biclust包中的算法或其他算法。该浏览器本身是使用Adobe Flex开发的,可以在支持flash的web浏览器中运行。

作者:Andreas Luscher < Andreas。Luescher在a3.epfl.ch>

维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“ExpressionView”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ExpressionView")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ExpressionView”)

PDF R脚本 ExpressionView
PDF ExpressionView文件格式
PDF R脚本 排序算法是如何工作的
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类GeneExpressionKEGG微阵列软件可视化
版本 1.40.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(10.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 caToolsbitops、方法、isa2eisaGO.dbKEGG.dbAnnotationDbi
进口 方法,isa2eisaGO.dbKEGG.dbAnnotationDbi
链接
建议 所有hgu95av2.dbbiclustaffy
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ExpressionView_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 ExpressionView_1.40.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) ExpressionView_1.40.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionView
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExpressionView
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ExpressionView/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网