此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ExpressionView.
Bioconductor版本:3.11
ExpressionView可视化了基因表达矩阵中可能重叠的双簇。它可以使用ISA方法(eisa包)的结果,也可以使用biclust包中的算法或其他算法。该浏览器本身是使用Adobe Flex开发的,可以在支持flash的web浏览器中运行。
作者:Andreas Luscher < Andreas。Luescher在a3.epfl.ch>
维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“ExpressionView”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ExpressionView")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ExpressionView”)
R脚本 | ExpressionView | |
ExpressionView文件格式 | ||
R脚本 | 排序算法是如何工作的 | |
参考手册 |
biocViews | 分类,去,GeneExpression,KEGG,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.40.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(10.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | caTools,bitops、方法、isa2,eisa,GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi |
进口 | 方法,isa2,eisa,GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | 所有,hgu95av2.db,biclust,affy |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ExpressionView_1.40.0.tar.gz |
Windows二进制 | ExpressionView_1.40.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | ExpressionView_1.40.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionView |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExpressionView |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExpressionView/ |
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