DelayedArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedArray

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DelayedArray．

一个用于透明处理磁盘上和内存中类似数组的数据集的统一框架

Bioconductor版本:3.11

将类数组对象(通常是磁盘上的对象)包装在DelayedArray对象中，可以对其执行常见的数组操作，而不必将对象加载到内存中。为了减少内存使用和优化性能，对对象的操作要么被延迟，要么使用块处理机制执行。注意，这也适用于内存中类似数组的对象，如DataFrame对象(通常带有Rle列)、Matrix对象以及普通数组和数据帧。

作者:Hervé Pagès ，由Peter Hickey < Peter贡献。hickey在gmail.com>和Aaron Lun

维护人员:Hervé Pagès

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DelayedArray")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DelayedArray”)

超文本标记语言		实现DelayedArray后端
PDF	R脚本	在R中使用大型数组
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，DataRepresentation，GenomeAnnotation，基础设施，软件
版本	0.14.1
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4)，方法，stats4，matrixStats，BiocGenerics(> = 0.31.5),S4Vectors(> = 0.25.15),IRanges(> = 2.17.3)
进口	统计数据,矩阵
链接	S4Vectors
建议	BiocParallel，HDF5Array，genefilter，SummarizedExperiment，气道，pryr，DelayedMatrixStats，knitr，BiocStyle，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	DelayedDataFrame，DelayedMatrixStats，GDSArray，HDF5Array，restfulSE，rhdf5client，singleCellTK，SummarizedExperiment，VCFArray
进口我	后面;，beachmat，bigPint，BiocSingular，bsseq，篮球选手，celaref，celda，ChIPpeakAnno，clusterExperiment，DEScan2，DSS，埃尔默，弗雷泽，GenoGAM，GenomicScores，glmGamPoi，gramm4R，hipathia，LoomExperiment，mbkmeans，methrix，methylSig，minfi，netSmooth，PCAtools，RTCGAToolbox，嘘，scDblFinder，scMerge，scmeth，食物，signatureSearch，单，VariantExperiment，weitrix
建议我	BiocGenerics，gwascat，iSEE，桅杆，S4Vectors，SQLDataFrame
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DelayedArray_0.14.1.tar.gz
Windows二进制	DelayedArray_0.14.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	DelayedArray_0.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedArray
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DelayedArray
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedArray/
包下载报告	下载数据