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DNAshapeR
DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAshapeR
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DNAshapeR。
高通量预测DNA的形状特征
Bioconductor版本:3.11
DNAhapeR是超高速的R / BioConductor包,高通量预测DNA的形状特征。包允许预测、可视化和编码DNA为统计学习形状特性。
作者:赵Tsu-Pei和费德里科•Comoglio
维护人员:Tsu-Pei赵< tsupeich usc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“DNAshapeR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DNAshapeR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DNAshapeR”)
| HTML | R脚本 | DNAshapeR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNA3DStructure,软件,StructuralPrediction |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.4),GenomicRanges |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings,字段 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | AnnotationHub,knitr,rmarkdown,testthat,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,脱字符号 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DNAshapeR_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DNAshapeR_1.16.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | DNAshapeR_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DNAshapeR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DNAshapeR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
