解读
DOI:10.18129 / B9.bioc.DECIPHER
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅解读。
工具进行管理、分析和操纵生物序列
Bioconductor版本:3.11
一个工具集用于解密和管理生物序列。
作者:埃里克·赖特
维修工:埃里克·赖特在pitt.edu < eswright >
从内部引用(R,回车引用(“破译”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“破译”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“破译”)
| R脚本 | 序列进行分类 | |
| R脚本 | 设计类属特异性的鱼类探测器 | |
| R脚本 | 设计类属特异性的引物 | |
| R脚本 | 设计微阵列探针 | |
| R脚本 | 设计引物,收益率与签名 | |
| R脚本 | 发现嵌合序列 | |
| R脚本 | 开始破解 | |
| R脚本 | 多重序列比对R的艺术 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 对齐,聚类,DataImport,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,微生物组,质量控制,测序,软件,可视化,WholeGenome,qPCR |
| 版本 | 2.16.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(9年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0),Biostrings(> = 2.35.12),RSQLite(> = 1.1),统计、并行 |
| 进口 | 方法,DBI,S4Vectors,IRanges,XVector |
| 链接 | Biostrings,S4Vectors,IRanges,XVector |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | AssessORF,SynExtend |
| 进口我 | AssessORFData,metagenomeFeatures,MicrobiotaProcess,openPrimeR |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DECIPHER_2.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | DECIPHER_2.16.1.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | DECIPHER_2.16.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/破译 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DECIPHER/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
