dchiprep

doi:10.18129/b9.bioc.dchiprep

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于3.11版的生物导体。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅dchiprep

Dchiprep-复制的染色质修饰芯片seq数据的分析

生物导体版本:3.11

DCHIPREP软件包实施了一种方法,以评估Chabbert等人所述的复制芯片seq研究中染色质修饰曲线之间的差异。Al -http://www.dx.doi.org/10.15252/msb.20145776。该方法的详细说明在软件文件中给出了https://doi.org/10.7717/peerj.1981

作者:Bernd Klaus [AUT,CRE],Christophe Chabbert [AUT],Sebastian Gibb [CTB]

维护者:伯恩德·克劳斯(Bernd Klaus)

引用(从r内,输入引用(“ dchiprep”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dchiprep”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dchiprep”)

html R脚本 dchiprepvignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,测序,,,,软件,,,,全媒体
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(5年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 r(> = 3.4),deseq2
进口 方法,统计,utils,GGPLOT2,,,,fdrtool,,,,RESHAPE2,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,最顺利,,,,plyr,,,,花花公子,,,,断言,,,,S4VECTORS,,,,purrr,,,,soggi,,,,Chippeakanno
链接
建议 MGCV,,,,测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dchiprep_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 dchiprep_1.18.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dchiprep_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dchiprep
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dchiprep
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dchiprep/
软件包下载报告 下载统计

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