这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
此软件包适用于3.11版的生物导体。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅dchiprep。
生物导体版本:3.11
DCHIPREP软件包实施了一种方法,以评估Chabbert等人所述的复制芯片seq研究中染色质修饰曲线之间的差异。Al -http://www.dx.doi.org/10.15252/msb.20145776。该方法的详细说明在软件文件中给出了https://doi.org/10.7717/peerj.1981
作者:Bernd Klaus [AUT,CRE],Christophe Chabbert [AUT],Sebastian Gibb [CTB]
维护者:伯恩德·克劳斯(Bernd Klaus)
引用(从r内,输入引用(“ dchiprep”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dchiprep”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ dchiprep”)
html | R脚本 | dchiprepvignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,测序,,,,软件,,,,全媒体 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | r(> = 3.4),deseq2 |
进口 | 方法,统计,utils,GGPLOT2,,,,fdrtool,,,,RESHAPE2,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,最顺利,,,,plyr,,,,花花公子,,,,断言,,,,S4VECTORS,,,,purrr,,,,soggi,,,,Chippeakanno |
链接 | |
建议 | MGCV,,,,测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dchiprep_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | dchiprep_1.18.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dchiprep_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dchiprep |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dchiprep |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dchiprep/ |
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