DBChIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.DBChIP

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DBChIP。

微分绑定ChIP-seq的转录因子

Bioconductor版本:3.11

DBChIP检测不同绑定锋利的结合位点在多个条件,有或没有匹配控制样本。

作者:库恩梁

维护人员:库恩梁< kliang stat.wisc.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DBChIP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DBChIP”)

PDF	R脚本	DBChIP
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,遗传学,测序,软件,转录
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.15.0),刨边机,DESeq
进口
链接
建议	ShortRead,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	metagene,metagene2
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DBChIP_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	DBChIP_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	DBChIP_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DBChIP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DBChIP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DBChIP/
包下载报告	下载数据