Crossicc

doi：10.18129/b9.bioc.crossicc

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅Crossicc。

用于多平台数据分析的交互式共识聚类框架

生物导体版本：3.11

CrossICC利用迭代策略从共识聚类生成的共识相似性矩阵中得出最佳基因集和群集数，并且能够处理多个跨平台数据集，因此不需要数据之间的正常化。该软件包还提供了可视化和识别癌症亚型的丰富功能。特别是，嵌入了许多与癌症相关的分析方法，以促进已鉴定的癌症亚型的临床翻译。

作者：Yu Sun [AUT，CRE]，Qi Zhao [aut]

维护者：yu sun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ crossicc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Crossicc”）

html	R脚本	如何使用Crossicc？
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	批处理效应，，，，分类，，，，聚类，，，，差异性，，，，特征提取，，，，GUI，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，微阵列，，，，正常化，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，软件，，，，生存，，，，可视化
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（1年）
执照	GPL-3 |文件执照
要看	r（> = 3.5），大量的
进口	Data.Table， 方法，梅尔玛德，，，，共识ClusterPlus，，，，林玛，，，，簇，，，，dplyr，，，，生物酶，grdevices，统计，图形，utils
链接
建议	rmarkDown，，，，测试，，，，尼特，，，，闪亮的，，，，发光的dashboard，，，，闪亮的widgets，，，，Shinycsssloaders，，，，DT，，，，ggthemes，，，，GGPLOT2，，，，pheatmap，，，，rcolorbrewer，，，，蒂布尔，，，，ggalluvial
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Crossicc_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	crossicc_1.2.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Crossicc_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crossicc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/crossicc
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/crossicc/
软件包下载报告	下载统计