CoverageView

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoverageView

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CoverageView．

R的覆盖可视化包

Bioconductor版本:3.11

该软件包为基因组覆盖剖面的可视化提供了一个框架。它可以用于ChIP-seq实验，但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他实验类型，其中重要的是要有一个框架，以检查覆盖如何分布在整个基因组

作者:Ernesto Lowy

维护者:Ernesto Lowy

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CoverageView")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CoverageView”)

PDF	R脚本	易于可视化的读覆盖
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，技术，可视化
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，Rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer
进口	S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，GenomicAlignments，平行，工具
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CoverageView_1.26.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	CoverageView_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoverageView
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CoverageView
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/
软件包下载报告	下载数据