此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅复杂的图像。
生物导体版本:3.11
复杂的热图有效地可视化数据集的不同来源之间的关联并揭示潜在模式。在这里,复杂的HeatMap软件包提供了一种高度灵活的方法来安排多个热图并支持各种注释图形。
作者:Zuguang Gu
维护者:Zuguang gu
引用(从r内,输入引用(“复杂Heatmap”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ consectHeatMap”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ complex -heatmap”)
html | complex_heatmap.html | |
html | R脚本 | 很可能问问题 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.4.3 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(5。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.1.2),方法,网格,图形,统计,grdevices |
进口 | 循环(> = 0.4.5),getoptlong,,,,色彩空间,,,,线索,,,,rcolorbrewer,,,,全球选择(> = 0.1.0),并行,PNG |
链接 | |
建议 | 测试(> = 1.0.0),尼特,,,,降价,,,,Dendsort,,,,开罗,,,,jpeg,,,,tiff,,,,快速积分,,,,Dendextend(> = 1.0.1),格里姆波特,,,,Grimport2,,,,胶水,,,,基因组机,,,,网格文本 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jokergoo/complexheatmaphttps://jokergoo..github.io/complexheatmap-reference/book/ |
取决于我 | amaretto,,,,富集图,,,,补偿 |
进口我 | Artms,,,,Bioconcotk,,,,BlackSheepr,,,,催化剂,,,,CETF,,,,可可,,,,可乐,,,,分解疾病,,,,DegReport,,,,dep,,,,diffcyt,,,,埃尔默,,,,富集兄弟,,,,FCCAC,,,,遗传,,,,Gmoviz,,,,冲动2,,,,我明白,,,,谱系,,,,妈妈,,,,马斯喀特,,,,mwastools,,,,Pathostat,,,,profileplyr,,,,setools,,,,Singlecelltk,,,,tbsignatureprofiler,,,,tcgaworkflow,,,,Xeva,,,,yapsa |
建议我 | 阿尔卑斯山,,,,clustifyr,,,,cnvranger,,,,Gtrellis,,,,Hilbertcurve,,,,Projectr,,,,tcgabiolinks,,,,tcgautils,,,,次级表演 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | complexheatmap_2.4.3.3.tar.gz |
Windows二进制 | consectHeatMap_2.4.3.3.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | complexHeatMap_2.4.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/complexheatmap |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/complexheatmap |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/complexheatmap/ |
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