这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CellNOptR。
Bioconductor版本:3.11
这个包做优化的布尔逻辑网络基于先前的知识网络的信号通路和一组数据在网络中的节点的扰动。
作者:T。Cokelaer F。Eduati,。业务。Schrier C。Terfve E。Gjerga, A.Gabor
维护人员:。伽柏<阿提拉。伽柏在uni-heidelberg.de >
从内部引用(R,回车引用(“CellNOptR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CellNOptR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CellNOptR”)
R脚本 | 主要装饰图案:使用CellNOptR玩网络 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,ImmunoOncology,网络,通路,蛋白质组学,软件,TimeCourse |
版本 | 1.34.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(9年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.5.0),RBGL,图、方法、哈希,RCurl,Rgraphviz,XML,ggplot2 |
进口 | igraph,stringi,stringr |
链接 | |
建议 | data.table,dplyr,tidyr,readr,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | Graphviz版本> = 2.2 |
增强了 | doParallel |
URL | |
取决于我 | CNORdt,CNORfeeder,CNORfuzzy,CNORode |
进口我 | |
建议我 | MEIGOR |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CellNOptR_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | CellNOptR_1.34.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | CellNOptR_1.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellNOptR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellNOptR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CellNOptR/ |
包下载报告 | 下载数据 |