类别

doi:10.18129/b9.BIOC.STAGERY

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅类别

类别分析

生物导体版本:3.11

用于执行类别的工具(基因集富集)分析的集合。

作者:Robert Gentleman [Aut],Seth Falcon [CTB],Deepayan Sarkar [CTB],Robert Castelo [CTB],Bioconductor套餐维护器[CRE]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“类别”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ category”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“类别”)

PDF R脚本 使用类别分析微阵列数据
PDF R脚本 将染色体带作为类别
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,,,,,基因烯,,,,途径,,,,软件
版本 2.54.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁)
执照 艺术2.0
要看 方法,stats4,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,生物酶,,,,矩阵
进口 UTIT,统计,图形,,,,rbgl,,,,gseabase,,,,GeneFilter,,,,注释,,,,DBI
链接
建议 ebarrays,,,,全部,,,,rgraphviz,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable(> = 1.4-6),HGU95AV2.DB,,,,kegg.db,,,,核粒子,,,,Geneplotter,,,,林玛,,,,格子,,,,运行,,,,org.sc.sgd.db,,,,gostats,,,,go.db
系统要求
增强
URL
取决于我 gostats,,,,PCPHENO
进口我 狂欢,,,,类别Compare,,,,CellHTS2,,,,Eisa,,,,GCMAP,,,,GMICR,,,,InteractiveSplay,,,,MESHR,,,,Mirlab,,,,PCPHENO,,,,,,,,ppistats,,,,rdavidwebservice,,,,报告工具,,,,sctensor
建议我 生物探测,,,,gsealm,,,,mmpalatemirna,,,,qpgraph,,,,rnbeads
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 catpory_2.54.0.tar.gz
Windows二进制 catpory_2.54.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) catpory_2.54.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/category
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/类别
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/category/
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