此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅类别。
生物导体版本:3.11
用于执行类别的工具(基因集富集)分析的集合。
作者:Robert Gentleman [Aut],Seth Falcon [CTB],Deepayan Sarkar [CTB],Robert Castelo [CTB],Bioconductor套餐维护器[CRE]
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“类别”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ category”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“类别”)
R脚本 | 使用类别分析微阵列数据 | |
R脚本 | 将染色体带作为类别 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,去,,,,基因烯,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 2.54.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15.5岁) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,stats4,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,生物酶,,,,矩阵 |
进口 | UTIT,统计,图形,,,,rbgl,,,,gseabase,,,,GeneFilter,,,,注释,,,,DBI |
链接 | |
建议 | ebarrays,,,,全部,,,,rgraphviz,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable(> = 1.4-6),HGU95AV2.DB,,,,kegg.db,,,,核粒子,,,,Geneplotter,,,,林玛,,,,格子,,,,运行,,,,org.sc.sgd.db,,,,gostats,,,,go.db |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | gostats,,,,PCPHENO |
进口我 | 狂欢,,,,类别Compare,,,,CellHTS2,,,,Eisa,,,,GCMAP,,,,GMICR,,,,InteractiveSplay,,,,MESHR,,,,Mirlab,,,,PCPHENO,,,,表,,,,ppistats,,,,rdavidwebservice,,,,报告工具,,,,sctensor |
建议我 | 生物探测,,,,gsealm,,,,mmpalatemirna,,,,qpgraph,,,,rnbeads |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | catpory_2.54.0.tar.gz |
Windows二进制 | catpory_2.54.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | catpory_2.54.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/category |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/类别 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/category/ |
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