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CancerSubtypes
DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes
此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CancerSubtypes．
基于多基因组数据集的癌症亚型识别、验证和可视化
Bioconductor版本:3.11
CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型识别计算生物学方法，为基于多组学数据(如基因表达、miRNA表达、DNA甲基化等)的癌症亚型分析提供了标准化框架。
作者:徐桃生<陶生。X在gmail.com>，Thuc Le
维护人员:徐涛声<涛声。X在gmail.com>
引用(从R中，输入引用(“CancerSubtypes”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CancerSubtypes")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“CancerSubtypes”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | CancerSubtypes |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类，GeneExpression，软件，可视化 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.4 (R-3.3)(4年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，sigclust，NMF |
| 进口 | SNFtool，iCluster，集群，嫁祸于，limma，ConsensusClusterPlusgrDevices,生存 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocGenerics，knitr，RTCGA.mRNA |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes |
| BugReports | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | CancerSubtypes_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CancerSubtypes_1.14.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | CancerSubtypes_1.14.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/癌变子类型 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
