CSSQ

DOI:10.18129 / B9.bioc.CSSQ

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CSSQ．

Chip-seq信号量化器管道

Bioconductor版本:3.11

该软件包旨在执行统计分析，以识别多组ChIP-seq数据集之间具有统计学意义的差异绑定区域。

作者:Ashwath Kumar [aut]，梅亚军[aut]，范玉红[aut]

维护人员:佐治亚理工学院风扇实验室。粉丝在biy.gatech.edu >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CSSQ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CSSQ”)

超文本标记语言	R脚本	CSSQ简介
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialPeakCalling，归一化，测序，软件
版本	1.0.5
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	SummarizedExperiment，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，rtracklayer
进口	GenomicAlignments，GenomicFeatures，Rsamtools，ggplot2， grDevices, stats, utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CSSQ_1.0.5.tar.gz
Windows二进制	CSSQ_1.0.5.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CSSQ_1.0.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CSSQ
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CSSQ
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CSSQ/
软件包下载报告	下载数据