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CNORfeeder
DOI:10.18129 / B9.bioc.CNORfeeder
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CNORfeeder。
整合CellNOptR添加缺失的链接
Bioconductor版本:3.11
这个包literature-constrained集成和数据驱动的方法来推断从扰动信号网络实验。它允许扩展给定网络链接来源于数据通过各种推理方法和使用信息的物理相互作用蛋白质指导和验证链接的集成。
作者:F。Eduati,大肠Gjerga
维护人员:E。Gjerga < enio。在gmail.com gjerga >
从内部引用(R,回车引用(“CNORfeeder”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CNORfeeder”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CNORfeeder”)
| R脚本 | 主要装饰图案:使用CNORfeeder玩网络 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,NetworkInference,蛋白质组学,软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0),CellNOptR(> = 1.4.0),图 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | minet,catnet,Rgraphviz,RUnit,BiocGenerics,igraph |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | MEIGOR |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CNORfeeder_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CNORfeeder_1.28.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | CNORfeeder_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNORfeeder |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CNORfeeder |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CNORfeeder/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
