萤石
DOI:10.18129 / B9.bioc.CAnD
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅萤石。
执行染色体血统的差异(萤石)分析
Bioconductor版本:3.11
函数执行萤石测试一组祖先比例。为特定的祖先的族群,用户将提供为每个样本比例估计血统,和感兴趣的每个染色体或染色体片段。每个染色体的假定值以及一个总体萤石假定值为每个测试将被返回。绘图函数也可以。
作者:凯特琳麦克休,蒂莫西•桑顿
维护人员:凯特琳麦克休< mchughc uw.edu >
从内部引用(R,回车引用(“萤石”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“萤石”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“萤石”)
| R脚本 | 检测异质性在染色体种群结构与“萤石”包 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | |
| 进口 | 方法,ggplot2,重塑 |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CAnD_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CAnD_1.20.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | CAnD_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAnD |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/萤石 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CAnD/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
