CAMTHC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMTHC

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅CAMTHCdebCAM(重命名)。

凸分析的混合组织的异质性特征

Bioconductor版本:3.11

R包组织异质性特征凸分析的混合物(CAM)。它提供基本功能对混合物进行无监督反褶积表达谱由凸轮和一些辅助功能来帮助理解subpopulation-specific结果。它还实现了功能来执行监督反褶积基于先验知识分子标记,S矩阵或矩阵。结合分子标记从凸轮和先验知识可以实现semi-supervised反褶积的混合物。

作者:陈露露< luluchen vt.edu >

维护人员:露露陈< luluchen vt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CAMTHC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CAMTHC”)

HTML	R脚本	CAMTHC用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,GeneExpression,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5)
进口	方法,rJava,BiocParallel统计数据,Biobase,SummarizedExperiment,corpcor,几何,NMF,nnls,DMwR,pcaPP,apcluster、图形
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,GEOquery,rgl
SystemRequirements	Java (> = 1.8)
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/CAMTHC/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CAMTHC_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CAMTHC_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CAMTHC_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMTHC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CAMTHC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAMTHC/
包下载报告	下载数据