相机

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMERA

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅相机。

质谱数据的收集相关的注释方法

Bioconductor版本:3.11

注释的peaklists由xcms生成,基于规则的同位素的注释和加合物,同位素验证、基于启德集团相关的标记未知的加合物和碎片

作者:Carsten库尔,拉尔夫Tautenhahn亨德里克•Treutler,史蒂芬诺伊曼{ckuhl | htreutle | sneumann} @ipb-halle.de, rtautenh@scripps.edu

维修工:史蒂芬诺伊曼< sneumann在ipb-halle.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“相机”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“相机”)

PDF		原子数与compoundQuantiles预期
PDF		用摄影机同位素模式验证
PDF	R脚本	分子识别与相机
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.44.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(11.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> =魅惑、方法Biobase,xcms(> = 1.13.5)
进口	方法,xcms,RBGL,图、图形、grDevices统计,跑龙套,Hmisc,igraph
链接
建议	faahKO,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了	Rmpi,雪
URL	http://msbi.ipb-halle.de/msbi/CAMERA/
BugReports	https://github.com/sneumann/CAMERA/issues/new
取决于我	flagme,首次公开募股,LOBSTAHS,MAIT,metaMS,PtH2O2lipids
进口我
建议我	cliqueMS,msPurity,mtbls2,RMassBank
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CAMERA_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	CAMERA_1.44.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	CAMERA_1.44.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMERA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/相机
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAMERA/
包下载报告	下载数据