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BioMM
DOI:10.18129 / B9.bioc.BioMM
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BioMM。
BioMM: Biological-informed多级机器学习框架表型预测使用的组学数据
Bioconductor版本:3.11
可再生的生物模式的识别从高维组学数据的一个关键因素在理解复杂疾病的生物学或特征。将之前的生物知识纳入机器学习推进这样的研究是一个重要的一步。我们提出了一个生物告诉多级机器学习框架称为BioMM专门为表型预测基于omics-scale数据之前,我们可以评估不同的机器学习模型生物元信息。
作者:Junfang陈和伊曼纽尔施瓦兹
维护人员:陈Junfang < Junfang。在gmail.com chen33 >
从内部引用(R,回车引用(“BioMM”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioMM”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BioMM”)
| HTML | R脚本 | BioMMtutorial |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,去,遗传学,通路,回归,软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.6) |
| 进口 | grDevices统计,跑龙套,晶格,BiocParallel,glmnet,rms,nsprcomp,管理员,e1071,variancePartition,ggplot2,pROC,vioplot,CMplot |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BioMM_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BioMM_1.4.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | BioMM_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioMM |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioMM |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioMM/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
