BUScorrect

DOI:10.18129 / B9.bioc.BUScorrect

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BUScorrect．

批效应校正与未知子类型

Bioconductor版本:3.11

高通量实验数据在公共数据库中呈指数级积累。然而，从这些丰富的资源中挖掘有效的科学发现受到技术人为因素和固有的生物异质性的阻碍。前者通常被称为“批效应”，后者通常由“子类型”建模。R包BUScorrect适合贝叶斯分层模型，即带有未知子类型的批处理效果-校正模型(BUS)，用于校正存在未知子类型的批处理效果。BUS能够(a)显式纠正批处理效应，(b)将具有相似特征的样本分组为子类型，(c)识别区分子类型的特征，以及(d)具有线性顺序的计算复杂度。

作者:罗翔宇< xy珞1991 at gmail.com>，魏莹莹

维护人员:Xiangyu Luo

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BUScorrect")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BUScorrect”)

PDF	R脚本	BUScorrect_user_guide
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，贝叶斯，聚类，FeatureExtraction，GeneExpression，软件，StatisticalMethod
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(2年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	gplots，方法，grDevices，统计，SummarizedExperiment
链接
建议	BiocStyle，knitr，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BUScorrect_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	BUScorrect_1.6.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	BUScorrect_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BUScorrect
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BUScorrect
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BUScorrect/
软件包下载报告	下载数据